数学的实践与认识

2017, v.47(19) 158-165

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基于k字位置序列的蛋白质序列分析方法及其应用
Based on k-word Position Sequence Analysis Methods of Protein Sequence and Application

王磊;高冰涛;薛晓龙;解小莉;

摘要(Abstract):

基于蛋白质序列的κ-字位置序列,利用标准化的κ-字区间平均距离和改进的标准化的κ-字区间平均距离的方法作为蛋白质序列的数字特征,并给出了比较蛋白质序列相似性的方法.最后,运用这两种方法分析了9个物种的ND5蛋白质序列和8个物种的ND6蛋白质序列的相似性,并利用交叉验证得出基于改进的标准化的κ-字区间平均距离的方法的准确度比基于标准化的κ-字区间平均距离的方法的准确度高.

关键词(KeyWords): 序列非比对分析;;遗传距离矩阵;;k-字;;蛋白质序列

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation):

作者(Author): 王磊;高冰涛;薛晓龙;解小莉;

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